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基于中医数据挖掘探讨桃红四物汤治疗结肠癌机制网络药理学研究

Network Pharmacology Study on the Mechanism of Taohong Siwu Decoction(桃红四物汤)in the Treatment of Colon Cancer Based on Data Mining of Traditional Chinese Medicine

摘要目的 通过网络药理学方法挖掘并研究桃红四物汤治疗结肠癌的化学基础和分子作用机制.方法 根据组成桃红四物汤的6味药物为关键词,分别输入TCMSP数据库与TCMID数据库进行检索,筛选药物活性成分;通过UniProt规范化配对耙点名称;以"Colon Cancer"为检索词,在数据库DisGeNET以及OMIM检索结肠癌对应基因靶点;通过Venny 2.1得到药物有效活性成分调控结肠癌的靶点基因;将靶点基因导入到STRING,获得PPI互作图,Cytoscape绘制桃红四物汤有效成分-结肠癌-靶点基因-作用通路的网络图并进行分析,根据节点确定核心蛋白,导入DAVID,获得GO与KEGG并完成富集分析.将作用靶点导入KEGG,得出KEGG信号图并进行分析,探讨桃红四物汤治疗结肠癌的作用靶点及相关通路信息,预测治疗结肠癌的机制.结果 检索出桃红四物汤61种活性成分,对应的药物基因223个,结肠癌基因靶点为161个.整理得到桃红四物汤有效成分与结肠癌靶基因的共同靶点为46个,挑选出药物有效成分为31个,通过PPI蛋白互作网络分析及有效成分-结肠癌-基因靶点-通路网络结构分析得出,其药物作用核心靶点为PTGS2、HSP90AA1、AKT1、TNF、TP53.获得GO过程122条,KEGG通路生物信息为85条.结论 桃红四物汤通过癌症通路癌、症蛋白聚糖、癌症通路、大肠癌、PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路、MicroRNA等通路作用于PTGS2、HSP90AA1、AKT1、TNF、TP53等核心靶点治疗结肠癌,其中癌症通路所包含的桃红四物汤的核心靶点基因计数及占比最多,被认为核心通路,通过数据挖掘出桃红四物汤治疗结肠癌的潜在的有效成分、靶点基因、生物过程及信号通路及其治疗其他恶性肿瘤及传染病的潜在价值,为下一步研究提供依据.

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DOI 10.13194/j.issn.1673-842x.2022.05.025
发布时间 2022-08-11(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
辽宁省科技攻关计划(2019JH2/10300040) 辽宁省科学技术基金(LNCCC-C07-2015)
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