换一批拜颤停复方对帕金森转基因模型小鼠脑组织泛素化蛋白质组学影响的研究
Ubiquitination Proteomics Effect of Research of Baichanting Compound(拜颤停)on Brain Tissue of Parkinson's Transgenic Model Mice
摘要目的 探讨拜颤停复方对帕金森转基因模型小鼠脑组织蛋白质泛素化修饰水平的影响.方法 转基因小鼠随机分为空白组、模型组、拜颤停复方组.通过蛋白提取、酶切、修饰肽段富集、质谱检测、生物信息分析等一系列前沿技术的有机结合,对样本进行修饰组学研究.运用泛素化蛋白质组学技术,鉴定各组样本中具有定量信息的泛素化蛋白质和泛素化修饰位点,运用基因本体论(GO)富集方法筛选各比较组在细胞组分(CC)、分子功能(MF)、生物进程(BP)层面上富集明显的过程.运用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集方法筛选富集明显的通路,进而寻找各通路中变化显著的标志性蛋白质.结果 共鉴定到泛素化修饰肽段9564条;鉴定到3058个蛋白上的9862个泛素化修饰位点,其中2132个蛋白上的7231个位点具有定量信息.模型组与空白组比较,累计差异修饰位点82个,差异蛋白71个;拜颤停复方组与模型组比较,累计差异修饰位点113个,差异蛋白108个.GO富集分析发现,泛素化差异主要体现在神经系统发育、神经发生、神经元投射、细胞投射等方面.KEGG通路富集筛选出ErbB信号通路、长时程增强等6条富集明显的通路.通路中共同差异泛素化蛋白为Ras、JNK、AMPAR、Rac1、RhoA、MAPK等,这些泛素化蛋白与帕金森相关通路关系密切.结论 拜颤停复方通过调控通路及通路中共同差异泛素化蛋白从而治疗帕金森.
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