换一批
换一批摘要为了揭示罂粟全基因组密码子使用的偏好性特征及其影响因素,以罂粟的全基因组蛋白质编码序列为研究对象,采用CodonW软件以及在线工具CUSP系统分析获得的68 828条蛋白质编码序列.研究结果显示:罂粟编码基因中的密码子平均GC含量为41.52%,第三位碱基的GC3s含量为33.61%.进一步分析表明密码子第三位置上四种碱基的使用程度依次为T>A>G>C,其基因密码子的有效密码子数(ENC)平均值为50.60.这些研究结果显示,罂粟基因偏好使用末尾以A或T的密码子,但这种使用的偏好性较弱.中性图、PR2-plot和ENC-plot的分析结果显示:除了自然选择外,突变和基因表达水平等因素也对使用罂粟基因组密码子产生了影响.通过分析同义密码子相对使用度(RSCU)值最终确定出22个最优密码子,主要以A和T结尾.研究结果为罂粟有效成分的基因表达系统选择及其基因工程提供了理论依据.
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分类号
R282.12
栏目名称
DOI
10.16595/j.1671-055X.2024.06.006
发布时间
2025-01-13
基金项目
六盘水市科技计划项目（52020(2022)PT-20）
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