基于生物信息学分析miRNA-103a-3p在子宫内膜癌中表达及临床意义
Analysis of the expression of miRNA-103a-3p in endometrial carcinoma and its clinical significance based on bioinformatic methods
摘要目的:基于生物信息学分析方法研究miR-103a-3p在子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)中的表达情况及其对预后的影响,评估其在EC中的临床意义.方法:本研究利用癌症基因图谱(TCGA)数据库分析miR-103a-3p在EC组织中的表达;利用Kaplan-Meier plotter数据库分析miR-103a-3p与EC患者预后相关性;利用miRWalk 2.0数据库获取miR-103a-3p的靶基因,同时采用DAVID 6.8数据库对靶基因进行GO和KEGG富集分析,进一步以Cytoscape 3.7.1软件构建靶蛋白互作(PPI)网络并筛选核心基因,通过数据库对核心基因进一步验证.结果:TCGA数据库分析显示,miR-103a-3p在EC组织中的表达水平显著高于正常组织.Kaplan-Meier生存分析显示,miR-103a-3p低表达EC患者的总生存时间明显多于高表达患者.GO分析显示,miR-103a-3p的靶基因显著富集到蛋白质结合、细胞质、细胞质基质、细胞膜、核质、ATP结合等生物学过程.KEGG分析显示,miR-103a-3p的靶基因显著富集于AMPK、Hippo等关键信号通路.CDC42、BDNF、FBXW7、CDC27、ACTR2、FASN、CDC23、CD40、FLT3、BAIAP2是miR-103a-3p潜在靶基因PPI网络中的核心基因,经数据库验证在EC中仅CD40的mRNA和蛋白水平显著降低.生存分析显示CD40低表达与EC患者预后不良相关.结论:EC组织中miR-103a-3p低表达在子宫内膜癌相关的生物学过程起重要作用,可能通过调控潜在靶基因CD40参与其中,有潜力成为EC诊断标志物、预后指标及治疗靶点.
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