换一批
换一批轮状病毒结构蛋白VP7 HLA-A2.1限制性CTL表位的初步鉴定
Primary identification of HLA-A2.1-restricted CTL epitopes from rotavirus protein VP7
摘要目的预测并初步鉴定轮状病毒Wa株结构蛋白VP7 HLA-A2.1限制性CTL表位.方法用BIMAS软件预测VP7HLA-A2.1限制性CTL表位;分子模拟技术对分值最高的4条肽进行分子模建;最后测定候选肽与HLA-A2.1分子的亲和力及结合稳定性.结果结合BIMAS及分子模拟的预测结果,选择4条肽QLYCDYNLV(132-140)、LLNYILKSV(18-26)、VLMKYDQSL(140-148)及VNWKKWWQV(287-295)作为候选表位肽;4条肽与HLA-A2.1结合的荧光系数(FI)值分别为2.58、3.83、3.19及0.82,肽-HLA-A2.1复合物半数解离时间(DC50)分别为2～4、6～8、8及2 h.结论QLYCDYNLV(132-140)、LLNYILKSV(18-26)及VLMKYDQSL(140-148)为潜在的HLA-A2.1限制性CTL表位.
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