HLA新等位基因HLA-A*11:193序列分析及蛋白质三维空间结构模拟
Sequence analysis of a novel allele HLA-A*11:193 and its encoding three-dimensional space of protein molecules
摘要目的 鉴定人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因A*11:193的碱基序列变异并模拟其编码蛋白质分子的三维空间结构.方法 应用PCR-SBT测序分型技术发现1例HLA-A位点等位基因结果异常样本,采用单等位基因特异性引物扩增测序进行序列鉴定.应用Swiss-Model网站和spdbv软件对其编码蛋白质分子三级结构模拟并分析.结果 该样本A位点存在1个新碱基序列,其与同源性最高的HLA-A*11:01:01相比,第4外显子nt662发生A → G的碱基替代,相应第197位密码子由CAT→CGT,其编码氨基酸由组氨酸(His)改变为精氨酸(Arg).结论 确认1例HLA-A新等位基因,该等位基因序列被WHO HLA因子命名委员会正式命名HLA-A11:193,其编码蛋白质分子三维结构与HLA-A*11:01:01未见明显差异.
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