换一批低级胶质瘤候选靶标及预后标志物SLC4 A家族的生物信息学分析
SLC4A gene family as candidate targets and prognostic biomarkers for low-grade gli-oma by bioinformatics analysis
摘要目的 采用生物信息学分析,筛选SLC4A基因家族中可作为低级胶质瘤(LGG)的候选靶标及预后标志物的基因.方法 利用TCGA、GTEx、UCSCXENA、GEPIA、cBioPortal、GeneMANIA、String等数据库,分析LGG患者SLC4A的差异表达、预后价值、遗传改变和蛋白互作等,根据数据筛选SLC4A基因家族中可作为LGG候选靶标及预后标志物的基因.结果 LGG 组织中 SLC4A2、SLC4A4、SLC4A7、SLC4A8 表达升高,而 SLC4A1、SLC4A3、SLC4A9、SLC4A10 表达降低.SLC4A2、SLC4A3、SLC4A4、SLC4A7、SLC4A10 在LGG肿瘤分级中表达存在显著差异.预后价值总生存率的分析发现,高表达SLC4A2、SLC4A3、SLC4A7、SLC4A8 和低表达SLC4A5、SLC4A10 的患者预后较差;无病生存率的分析发现,高表达 SLC4A2、SLC4A3、SLC4A8 和低表达 SLC4A10 的患者预后较差.结论 SLC4A2、SLC4A3、SLC4A7、SLC4A8、SLC4A10 可能是LGG潜在候选靶标及预后标志物.
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分类号
R730（肿瘤学一般性问题）
栏目名称
DOI
10.15972/j.cnki.43-1509/r.2023.04.005
发布时间
2023-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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