肿瘤潜在侯选靶标及标志物ADAM17的生物信息学分析

Bioinformatics analysis of potential candidate targets and biomarker ADAM 17 in tumors

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摘要目的采用生物信息学分析肿瘤组织潜在侯选靶标及标志物ADAM17的结构和功能特点.方法运用ProtParam 和 ProtScale、STRING12.0、The Human Protein Atlas 和 cBioPortal 等不同数据库,对人 ADAM 17 理化性质、跨膜区域、信号肽、核定位序列、磷酸化和糖基化位点、亚细胞定位、二级/三级结构、蛋白互作网络、不同肿瘤组织中的表达以及遗传改变等进行分析.采用免疫组化对肺、结肠组织的肿瘤组织和正常样本ADAM 17表达进行验证.结果人ADAM 17是由824个氨基酸构成的亲水性蛋白;分子式为C4066H6356N1124O1277S50,理论等电点为5.50,平均亲水性为-0.573;定位于细胞质,具有1个跨膜结构域、1个信号肽以及2个核定位序列;二级结构主要由不规则卷曲组成,存在89个磷酸化位点、5个N-糖基化位点和9个O-糖基化位点;广泛分布于正常组织中,并在膀胱尿路上皮癌、宫颈鳞状细胞癌、结肠癌(COAD)、肾透明细胞癌、肝脏肝细胞癌和肺鳞状细胞癌(LUSC)中高表达,能与金属蛋白酶抑制因子3、表皮生长因子等主要蛋白发生相互作用,参与肿瘤坏死因子、核因子-κB等信号通路.免疫组化验证结果显示,ADAM 17在人肺、结肠正常组织中低表达,而在LUSC、COAD组织中高表达.结论 ADAM 17可能是肿瘤的潜在候选靶标及标志物.