摘要针对不同蛋白质选取不同的氨基酸指数进行蛋白质研究,提取氨基酸序列的位置和排列信息在频率上的特征频谱作为特征向量,通过计算特征向量的距离考察蛋白质的相似性.这是一种非比对相似性的判别方法.蛋白质组的聚类结果表明,蛋白质序列在频率域上的特征提取方法具有一定的应用价值和生物学意义.
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关键词
氨基酸序列互相关自相关特征提取向量序列傅里叶变换信噪比amino acid sequencecross correlationauto-correlationfeature extraction Fourier transform of vector sequencessignal to noise ratio
分类号
Q811.4
DOI
10.3969/j.issn.1671-7627.2013.06.023
发布时间
2014-01-02
基金项目
南京工业大学青年教师基金(44204117)
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