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乙型肝炎病毒核酸与同义密码子的遗传特点分析

The genetic features of nucleotide composition and synonymous codon usage of hepatitis B virus

摘要乙型肝炎病毒是一种严重威胁公共健康的病毒性传染病。本文分析了乙型肝炎病毒基因组中开放阅读框中所有编码阅读框序列的遗传特征,于此同时我们还分析了病毒同义密码子使用模式与不同模式生物密码子使用模式的差异性。结果发现,乙型肝炎病毒基因对同义密码子使用的频率是不均一的,其中TCC,TCT,AGT,AGA是过量使用的,而ACC,CGG,GCC,ATA,CGT,CCC,TCG和GGT的使用频率极低。通过分析病毒与不同模式生物的密码子使用模式的差别,发现病毒自身的核苷酸变异和宿主对其自然选择的遗传压力是乙型肝炎病毒在遗传进化方面达到了一个相对平衡的局面。

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