换一批基于生物信息学分析NEIL3在肝细胞癌中的表达及其临床意义
NEIL3 expression and clinical significance in hepatocellular carcinoma based on bioinformatics
摘要目的:基于生物信息学分析Nei核酸内切酶Ⅷ样3(Nei endonucleaseⅧ-like 3,NEIL3)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达和临床意义.方法:利用TCGA数据库的mRNA数据和临床数据分析NEIL3在肝细胞癌中的表达和临床意义.使用GEPIA和Kaplan-Meier数据库分析NEIL3表达对HCC患者预后的影响.使用UALCAN和cBioPortal数据库分析NEIL3在HCC中的甲基化水平.使用STRING、Metascape和LinkedOmics探索NEIL3在HCC中的潜在作用机制.结果:与正常组相比,NEIL3在HCC显著高表达.临床相关性分析结果显示,NEIL3表达与患者的病理分期及肿瘤大小呈负相关.Kaplan-Meier生存曲线显示,NEIL3高表达与HCC患者较差的总体生存期、无病生存期、无进展生存期、无复发生存期有关.表观遗传学研究发现,NEIL3基因的低甲基化可能是NEIL3在HCC中表达上调的原因之一.功能富集分析发现,NEIL3可能通过参与细胞周期、DNA复制、同源重组、错配修复、p53信号通路、碱基切除修复、剪接体和乙型肝炎相关等信号通路促进HCC发生发展.结论:生物信息学分析显示,NEIL3在HCC组织中显著高表达,且与患者的不良临床结局相关,可作为HCC的潜在治疗靶点和预后生物标志物.
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分类号
R735.7（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1671-6264.2022.03.014
发布时间
2022-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
北京市平谷区医院科研项目（pgyy2018-31）
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