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基于CRISPR/Cas13a技术检测肿瘤驱动基因TP53 R248W的研究

Detection of tumor driver gene TP53 R248W by CRISPR/Cas13a

摘要目的:建立一种基于CRISPR/Cas13a的TP53 R248W变异体的快速检测技术.方法:根据Over-lap PCR技术,以TP53野生型质粒为模板构建TP53 R248W变异体质粒;对TP53R248W变异体扩增产物大小,扩增反应条件及crRNA长度和浓度进行优化,初步建立基于CRISPR/Cas13a的R248W变异体快速检测方法;利用不同突变率TP53 R248W变异体及模拟血浆ctDNA,评价CRISPR/Cas13a方法的检测灵敏度.结果:建立的CRISPR/Cas13a方法成功检测出产物大小为368 bp的TP53 R248W片段;在0.05~0.25 μmol/L浓度范围内,crRNA浓度越高,检测结果相对荧光值越高;该方法检测TP53 R248W变异体的灵敏度为1×104拷贝/μL,最低可以检测出突变率为0.01%的变异体.结论:建立的CRISPR/Cas13a方法具有快速、简便、灵敏、特异等优点,为组织和血浆中的TP53 R248W变异体的检测提供了新的技术手段.

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作者 邝振展 [1] 肖斌 [2] 孙朝晖 [1] 罗镕 [3] 何洁雯 [4] 李林海 [2] 学术成果认领
栏目名称
DOI 10.7655/NYDXBNS20220811
发布时间 2022-10-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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南京医科大学学报(自然科学版)

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