江苏省吕四港潮间带贝类的蛋白质组分析

Proteomic Profiling in Shellfish From Lüsi Aquaculture in the Intertidal Zone Area of the Jiangsu Province

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摘要潮间带滩涂是江苏省海岸线的重要特征,腹足类、双壳贝类海洋生物资源丰富.该文基于shotgun蛋白质鉴定技术研究江苏省吕四港地区主要贝类的蛋白质组成.采用nano-LC MS/MS技术从9种贝类生物中共鉴定了265个蛋白质,其中角螺中鉴定的蛋白质最多(105个),从毛蚶中鉴定的蛋白质最少(39个).这些蛋白质以细胞骨架蛋白为主,如微管蛋白、肌动蛋白、原肌球蛋白、肌球蛋白重链及组蛋白;另外还鉴定出核糖体蛋白、精氨酸激酶、ATP合成酶、延伸因子、热休克蛋白等.采用PCA分析法将蛋白质按照细胞成分与分子功能进行统计分析,结果表明缢蛏、泥螺与角螺的蛋白质组成相似,而竹蛏、文蛤、杂色蛤和四角蛤蜊的蛋白质组成相似.Heatmap和聚类分析结果表明,杂色蛤和西施舌被聚为一类,而缢蛏、泥螺、角螺、文蛤、毛蚶和四角蛤蜊被聚为另一类,竹蛏与这两类距离较远.该文研究建立了江苏沿海潮间带主要贝类中蛋白质组成特点比较分析的方法,有利于江苏沿海贝类资源开发利用.

作者盛乃娟 ^[1] 王倩 ^[1] 吴体智 ^[1] 陈晓钰 ^[1] 李晓芳 ^[1] 刘睿 ^[1] 吴皓 ^[1] 学术成果认领

作者单位南京中医药大学,江苏省海洋药用生物资源研究与开发重点实验,江苏省中药资源产业化过程协同创新中心,中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心,江苏南京210023 ^[1]

关键词蛋白质组贝类江苏主成分分析潮间带 proteomic shellfish Jiangsu PCA intertidal zone

主题词贝类(Shellfish)蛋白质组(Proteome)蛋白(Egg White)主成分分析(Principal Component Analysis)角(Horns)

分类号 R282.77

栏目名称 海洋药用生物资源研究开发

DOI 10.14148/j.issn.1672-0482.2018.0222

发布时间 2018-10-11

基金项目

国家海洋公益性行业科研专项 国家高新技术研究发展计划(“863”计划)项目 江苏高校优势学科建设工程资助项目 江苏省海洋科技创新专项 药用南珠标准化养殖与综合利用产业链协同创新 江苏省高等学校自然科学研究重大项目 江苏省高校“青蓝工程”优秀青年骨干教师 江苏省“333工程”第三层次