下肢外周动脉疾病铁死亡相关基因的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Ferroptosis-related Genes in Peripheral Artery Disease of Lower Extremities

二维码有效期 120s

摘要目的探索下肢外周动脉疾病的潜在铁死亡相关生物标志物及诊断治疗靶点.方法应用生物信息学方法从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载下肢外周动脉疾病的转录组数据集,筛选出差异表达基因(differential expressed genes,DEGs),并与铁死亡基因取交集,得到下肢外周动脉疾病相关的铁死亡基因,对其进行功能富集,同时通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析下肢外周动脉疾病相关的铁死亡基因的诊断价值;之后构建蛋白质相互作用网络,应用Cytoscape中的算法预测关键基因;最后通过miRWalk预测靶向关键基因的miRNA并构建网络图.结果共筛选出 9 个下肢外周动脉疾病铁死亡相关基因,GO与KEGG的功能富集分析结果表明,这些基因与铁死亡、免疫调节、凋亡及糖尿病、动脉粥样硬化等相关,ROC诊断提示下肢外周动脉疾病患者中 9 个相关的铁死亡基因的平均曲线下面积(area under the curve,AUC)为 0.930;基于算法筛选出 4 个关键基因:HMOX1、ALOX5、IL1B和CY BB,而CY BB和HMOX1 同时受miR-6734-3p调控.结论通过生物信息学方法分析得出HMOX1、ALOX5、IL1B和CY BB在下肢外周动脉疾病中存在诱导铁死亡的潜在作用,而miR-6734-3p作为HMOX1 与CY BB的共同靶向miRNA,有望成为潜在诊断生物标志物及治疗靶点.