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DDRT-PCR技术分析籽粒苋镉胁迫下相关基因的差异表达

Analysis of Differentially Expressed Genes of Amaranthus hypochondriacus Under Cadmium Stress by DDRT-PCR

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摘要以镉污染修复植物籽粒苋（Amaranthus hypochondriacus）的根、叶、果为实验材料，利用DDRT-PCR技术分析籽粒苋Cd胁迫下基因表达水平的变化。结果表明：回收差异片段获得镉处理诱导的4个差异表达序列（EST-1、EST-2、EST-3和EST-4），经Blastn比对，EST-1与土人参26S核糖体RNA基因部分序列（GB|HQ843466.1）一致性为99％，EST-2与虎耳草26S核糖体RNA大亚基基因部分序列（GB|AF036498.1）一致性为93％，EST-3与大肠杆菌菌株TW 14359 DNA聚合酶Ⅲα亚基基因（ECs0186）完整CDS（GB|EU906049.1）一致性为97％，EST-4与米曲霉RIB40β-葡萄糖苷酶基因（XM 001816779.2）一致性为99％；经Blastx比对， EST-1与假定蛋白MTR 5g051030[苜蓿]（XP 003614386.1）氨基酸序列相似性为26％，EST-2与假定衰老相关蛋白[柏杉]（GB|ACA30301.1）氨基酸序列一致性为98％，EST-3与DNA聚合酶Ⅲα亚基[大肠杆菌OP50]（ZP 06935700.1）氨基酸序列一致性为100％，EST-4与β-葡萄糖苷酶[黄曲霉NRRL3357]（XP 002383240.1）氨基酸序列一致性为99％；4个差异表达基因通过调控蛋白质代谢、DNA复制和糖代谢等途径来应答镉胁迫。