基于串联质量标记的Aβ1-42诱导的BV2小胶质细胞定量蛋白质组学分析
Quantitative proteomics analysis of BV2 microglial cells induced by Aβ1-42 based on tandem mass tagging
摘要目的 通过对Aβ1-42寡聚体诱导的BV2小胶质细胞进行定量蛋白质组学分析,深入研究阿尔茨海默病(AD)的差异蛋白表达谱,以揭示AD潜在的病理生理学机制.方法 采用基于串联质量标签(TMT)标记的液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)定量蛋白质组学技术分析A β 1-42寡聚体诱导的BV2小胶质细胞与对照组的差异蛋白表达.差异倍数(FC)>1.5和统计学意义(P-value)P<0.05的蛋白被认为是差异表达蛋白(DEPs).采用基因集富集分析(GSEA)对定量到的所有蛋白进行生物学信息分析,以了解蛋白质的基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科(KEGG)通路富集情况.结果 本研究在Aβ 1-42寡聚体诱导的BV2小胶质细胞中共鉴定到68个DEPs,其中8个蛋白表达上调,60个蛋白表达下调.生物信息学分析表明,DEPs主要通过下调缺氧诱导因子-1α(HIF1 α)蛋白和铁蛋白重链1(FTH1)蛋白参与AD细胞凋亡和铁死亡的调控.结论 研究结果表明,Aβ1-42寡聚体诱导的BV2小胶质细中HIF1α蛋白和FTH1蛋白表达下调,分别通过参与调控细胞凋亡和铁死亡过程而在AD发生发展中发挥作用.本研究通过对A β 1-42诱导的BV2小胶质细胞进行定量蛋白质组学分析来揭示AD发病机制,为发现潜在蛋白干预靶点提供了新思路.
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