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基于生物信息学进行衰老相关的帕金森病生物标志物的筛选

Screening of aging-related biomarkers for Parkinson's disease based on bioinformatics

摘要目的 通过人类衰老基因组资源数据库(HAGR)和基因表达综合数据库(GEO)来确定帕金森病(PD)中潜在的衰老生物标志物,为改善PD的治疗和诊断提供新的见解.方法 分别从GEO和HAGR数据库获取人类PD数据集和衰老相关基因,进行差异表达基因的分析,使用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析等生物信息学方法,采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)、随机森林(RF)、最小绝对收缩与选择算子(LASSO)回归、支持向量机递归特征消除法(SVM-RFE)等机器学习算法筛选枢纽基因,应用实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)对枢纽基因进行临床验证.结果 枢纽基因YWHAZ在区分正常组和PD组方面具有较强的诊断潜力.此外,qRT-PCR检测显示,PD组中YWHAZ mRNA的表达水平低于正常组.结论 与衰老相关的枢纽基因YWHAZ,有助于了解PD中衰老的潜在机制,并可能作为PD的诊断和治疗靶点.

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