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从江香猪lncGHR1基因的克隆、组织表达及超表达研究

The Cloning, Tissue Expression and Over-expression Study of lncGHR1 Gene in Cong Jiang Xiang Pig (Sus scrofa)

摘要生长激素受体(growth hormone receptor,GHR)在动物生长发育过程中具有重要作用.为研究GHR基因相关长链非编码RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)在从江香猪(Sus scrofa)不同组织中的表达规律,本研究以贵州从江香猪和大白猪为研究对象,以生长发育相关的miR-146b-3p为关联点,通过SWChen 2.3程序筛选GHR相关lncRNAs,对筛选出来的lncRNAs进行克隆验证.以候选lncRNA NONSUST017828.1(GenBank No.TCONS_00020564,命名为lncGHR1)为研究对象,对其进行生物信息学及组织表达谱分析,并构建lncGHR1-CMV超表达载体,转染至人源胚胎肾细胞(human embryonic kidney cells,HEK-293T)和从江香猪原代肌细胞,检测细胞增殖相关基因YAP(Yes-associated protein)和TAZ(transcription activator)的表达情况.结果显示,lncGHR1二级结构最小自由能为-131.20 kcal/mol,含3个ORF;局部比对结果发现,lncGHR1与猪GHR 3'UTR相似程度最高;lncGHR1与miRNA结合的抑制系数为4.96%,其中miR-146-3p与lncGHR1亲和评分最高.lncGHR1在从江香猪脾脏和肺脏中表达量最高,心脏中最低;在大白猪肝脏中表达量最高,心脏中最低;lncGHR1在从江香猪脾脏、肺脏、背最长肌和小肠中的表达量均极显著高于大白猪(P<0.01),但肝脏中的表达量极显著低于大白猪(P<0.01),其他组织表达差异不显著.lncGHR1在HEK-293T细胞和从江香猪原代肌细胞中的超表达,显著提高TAZ基因的表达(P<0.05),但对YAP影响不大(P>0.05).以上结果表明lncGHR1在生长发育过程中发挥了重要作用,对解析从江香猪生长缓慢、个体矮小的成因机制及猪的遗传改良育种具有重要意义.

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作者 崔小芝 [1] 吴巧群 [1] 吴小敏 [1] 朱晓锋 [1] 谌颖莲 [2] 谢玲玲 [3] 赵佳福 [1] 陈伟 [1] 许厚强 [4] 学术成果认领
分类号 S828
栏目名称 研究论文与报告
DOI 10.3969/j.issn.1674-7968.2020.12.007
发布时间 2020-12-21
基金项目
国家科技支撑计划 贵州省农业重大产业科学研究攻关项目 贵州省科技计划项目 贵州大学2017年度学术新苗培养及创新探索专项
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