基于网络药理学及分子对接分析手参属藏药材抗肿瘤作用机制
Analysis of the Anti-tumor Mechanism of Tibetan Medicinal Materials of the Gymnadenia Genus Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
摘要目的 基于网络药理学及分子对接分析手参属藏药材抗肿瘤作用机制.方法 查阅Web of Science、PubMed和CNKI等数据库中的文献,查找手参属藏药材的化学成分,在pubchem、SwissTargetPrediction数据库中获取手参属藏药材的有效成分和作用靶点;在GeneCards、OMIM数据库获取疾病靶点;利用STRING数据库进行蛋白质相互作用(PPI)分析;利用Cytoscape软件进行拓扑分析,筛选出关键靶点;使用Metascape数据库对关键靶点进行基因本体(GO)和基因组京都百科全书(KEGG)富集分析;最后通过AutoDockTools-1.5.6软件对手参属藏药材化合物主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证,并用PyMOL软件进行分子对接结果可视化分析.结果 手参属藏药材有14个核心成分,即Benzyl beta-d-glucopyranoside、Methylarbutin、Isoarundinin Ⅱ、Isoarundinin Ⅰ、Bulbocodin D、Bulbocodin C、Arundinin、Gymconopin C、2-Methoxy-9,10-dihydrophenanthrene-4,5-diol、Coelonin、1-[(4-Hydroxyphenyl)methyl]-4-methoxyphenanthrene-2,7-diol、1-(4-Hydroxybenzyl)-4-methoxy-9,10-dihydrophenanthrene-2,7-diol、Blestriarene A、4-Methoxybenzenepropanol;关键靶点包括 CA9、CA2、CDK1、CDK2、ESR2、MMP1、ADAM17,分子对接结果显示手参属藏药材的主要核心成分和核心靶点之间有较好的结合活性.结论 手参属藏药材中多种活性成分通过作用于CA9、MMP1、ADAM17等关键靶点,调节多条信号通路,进而抑制肿瘤细胞增殖并促进其凋亡,发挥抗肿瘤作用.
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