换一批
换一批艰难拟梭菌SpoOA蛋白结构及分子特性的生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of Structure and Molecular Characteristics of SpoOA Protein from Clostridioides difficile
摘要为了分析艰难拟梭菌SpoOA蛋白的结构及分子特性,本研究从NCBI蛋白质数据库中下载艰难拟梭菌SpoOA蛋白的氨基酸序列,分别采用ProtParam、Motif Scan、PSIPRED、SMART等在线分析程序预测其理化性质、翻译后修饰位点、二级结构和保守结构域,并利用MEGA 6.06 软件为不同物种来源的SpoOA蛋白构建进化树.结果表明,艰难拟梭菌SpoOA蛋白序列长度为274 aa,分子量为30.85 kDa,等电点理论值为6.33,不存在信号肽及跨膜结构域,并定位于胞质中.SpoOA蛋白含有REC和SpoOA C两大结构域,二级结构由10 个α螺旋和10 个β折叠组成,含有6 个酪蛋白激酶II磷酸化位点、1 个N-肉豆蔻酰化位点和1 个蛋白激酶C磷酸化位点.不同物种来源的SpoOA蛋白分为两大支,其中7 种芽孢杆菌聚为一支,4 种梭菌聚为另外一支.本研究运用生物信息学方法分析了艰难拟梭菌SpoOA蛋白的保守结构域及翻译后修饰位点,为进一步研究其调控毒素表达的机制提供参考.
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关键词
艰难拟梭菌SpoOA蛋白结构分子特性生物信息学Clostridioides difficileSpoOAProtein structureMolecular characteristicsBioinformatics
分类号
R111
栏目名称
试验研究
DOI
10.3969/j.issn.1003-7950.2023.03.006
发布时间
2023-11-13
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