青藏高原地区分离的叶氏夏柏特线虫鉴定及其遗传进化分析
Identification and Phylogenetic Analysis of Chabertia Erschowi Isolated from Qinghai-Tibetan Plateau Area
摘要为鉴定分离到的线虫种类及其遗传进化特征,本研究通过对该线虫进行形态学特征观察,采用线虫cox1 基因通用引物,利用PCR扩增并测序,初步鉴定该线虫.形态学特征观察结果显示,线虫为幼虫,长约 200~300 μm,虫卵呈椭圆形,虫卵长约85~132 μm,宽42~56 μm;PCR结果显示,在约440 bp处出现与预期目的片段大小相符的条带.测序结果显示,该基因序列与叶氏夏柏特线虫(Chabertia erschowi)cox1 基因序列的同源性高达99.09%,初步表明该线虫为C.erschowi.采用C.erschowi的ITS2 特异性基因引物经PCR进一步鉴定并测序.将2 个基因测序结果与GenBank登录的C.erschowi的相应基因序列比对,分析它们之间的同源性,并构建这2 个基因的进化树,分析它们之间的遗传进化关系.PCR结果显示,扩增到约 330 bp(ITS2)的目的条带.同源性分析结果显示,ITS2 基因序列与GenBank登录的C.erschowi相应基因序列的同源性最高分别达 100.00%.进化树结果显示,该虫株的2 个基因均与不同宿主的C.erschowi处于同一分支.本研究成功鉴定了分离的线虫为叶氏夏柏特线虫,并分析其线粒体基因同源性及遗传演化关系,为叶氏夏柏特线虫的分类、鉴定和种群遗传进化分析及分子流行病学调查等奠定了研究基础.
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