基于基因芯片技术新疆汉族食管鳞癌差异表达mRNA的筛选
Screening of mRNA differentially expressed genes in esophageal squamous cell carcinoma of Xinjiang Han population based on cDNA microarray technology
摘要目的 食管癌是全球常见的的恶性肿瘤,新疆为发病率较高的地区之一.本研究旨在完善新疆汉族食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)基因表达谱,进一步了解ESCC的发生、发展机制,提供与ESCC的预防、诊断及治疗相关的新的生物标志.方法 收集2014-11-03-2015-09-25新疆石河子大学医学院第一附属医院兵团内镜中心6例汉族中分化ESCC患者的癌组织和癌旁正常组织(距癌组织>5 cm).利用基因芯片技术检测新疆汉族ESCC的差异表达基因.结果 共筛选出汉族ESCC差异表达的mRNAs 335个,其中有138个表达上调的mRNAs和197个表达下调的mRNAs,差异倍数(fold change,FC)≥2且P<0.01,这些基因涉及多种生物学功能及通路.结论 利用基因芯片技术基于人类全基因谱筛选了新疆汉族ESCC差异表达基因,完善了新疆汉族ESCC基因谱,为ESCC的诊断及预后的进一步研究打下基础.
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