结直肠癌组织ZNF655基因启动子甲基化状态及其临床意义
Aberrant promoter methylation status of ZNF655 in colorectal cancer and its clinical significance
摘要目的 DNA启动子异常甲基化所导致的相关基因失活是结直肠癌发生发展过程中的重要机制.本研究探讨ZNF655基因启动子区甲基化在结直肠癌组织及其淋巴结转移癌组织中的状态,以及与临床病理参数的相关性,探讨其在结直肠癌进展过程中发挥的作用.方法 收集2014-01-01-2016-12-31山东省千佛山医院病理科保存的12例结直肠原发癌组织及其对应的淋巴结转移癌组织和正常肠黏膜组织(距原发癌边缘>5 cm)进行全基因组甲基化测序;选取67例结直肠癌样本(包括12例测序样本和30例保存完整的新鲜组织样本),采用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)对测序结果中差异倍数>|1|的候选基因ZNF655启动子区甲基化状态进行检测;30例新鲜样本通过qRT-PCR技术检测正常组织及癌组织中ZNF655 mRNA表达水平;采用免疫组织化学方法检测正常组织及癌组织中ZNF655蛋白表达;分析ZNF655基因启动子区异常甲基化与结直肠癌患者临床病理参数的关联.结果 12例结直肠癌样本测序结果显示,原发癌组织及淋巴结转移癌组织中ZNF655甲基化水平高于正常肠黏膜组织,P=0.008,Log2 FC=1.64;验证性实验中,67例结直肠癌组织中ZNF655启动子区甲基化频率为68.7%(46/67),高于正常黏膜组织的28.4%(19/67),差异有统计学意义,x2=21.781,P<0.001;癌组织中ZNF655基因启动子区高甲基化与其mRNA表达下调有统计学意义的关联,x2 =5.487,P=0.032;ZNF655在正常肠黏膜及结直肠癌原发灶中的阳性表达率分别为77.6%(52/67)和58.2%(39/67),差异有统计学意义,x2=5.787,P=0.026;癌组织中ZNF655基因启动子区高甲基化与癌分化程度(x2=6.206,P=0.013)和淋巴结转移(x2=4.331,P=0.037)有统计学意义的关联.结论 结直肠癌组织中ZNF655基因启动子区异常高甲基化,可能参与结直肠癌的发生发展过程,或将作为潜在的诊断标志物及治疗靶点.
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