通过生物信息学评估CDKN2A的表达对头颈部鳞状细胞癌预后价值

Evaluate the value of CDKN2A expression on the prognosis of head and neck squamous cell carcinoma assessed by bioinformatics

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摘要目的分析细胞周期依赖性激酶抑制基因(CDKN2A)在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达对其预后的影响.方法通过生物信息学,利用从TCGA数据库和Oncomine下载的头颈鳞癌患者mRNA及临床资料,分析CDKN2A基因在多种癌症中的表达情况、以及其在配对和非配对的头颈鳞癌样本中的表达,采用Kaplan-Meier方法和Cox回归分析CDKN2A在HNSCC中的临床特征关系及预后价值.结果对于TCGA数据库下载的数据进行分析,可以得到CDKN2A在33种癌症中的表达情况,发现CDKN2A在膀胱癌、卵巢癌、宫颈癌、胰腺癌及头颈鳞癌中高表达(P<0.001);只在睾丸生殖细胞癌(TGCT)中表达下降(P<0.001);对546例头颈鳞状细胞癌及正常组织进行分析,发现CDKN2A在HNSCC中高表达(P<0.001);在头颈部鳞状细胞癌中CDKN2A的表达与患者的T分期(P=0.006)、性别(P=0.012)、病理分级(P=0.002)、解剖部位(P<0.001)、吸烟(P<0.001)有关;将546例头颈鳞状细胞癌患者分为高、低表达CDKN2A两组,总体生存时间(OS)、疾病特异性生存期(DSS)、无进展生存期(PFI)具有显著差异;ROC分析CDKN2A mRNA表达水平对预测患者有较好敏感性.结论 CDKN2A在头颈鳞状细胞癌中高表达,与其临床特征和患者预后情况具有相关性,可以作为预测头颈部鳞状细胞癌不良预后的一种潜在标志物.