换一批结直肠癌中环状RNA介导竞争性内源RNA网络及预后价值研究
Study of cyclic RNA-mediated competitive endogenous RNA network and prognostic value in colorectal cancer
摘要目的 旨在通过对结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)中circRNA、miRNA和mRNA的表达谱数据进行差异表达分析,探讨circRNA在结直肠癌中的竞争性内源性RNA(ceRNA)机制、潜在生物学功能及预后关联生物标志物.方法 采用生物信息学分析方法,从GEO和TCGA数据库获取相关数据集,使用R语言进行数据处理及分析,筛选出具有差异表达的circRNA、miRNA和mRNA并构建ceRNA网络,对网络中关键节点枢纽基因进行GO功能富集、KEGG通路及生存分析.结果 在CRC中有55个circRNAs、31个miRNAs和677个mRNAs呈现出差异表达,通过预测circRNA与miRNA的结合位点以及miRNA靶基因,构建一个由6个circRNAs、5个miRNAs和15个mRNAs组成的ceRNA网络,对网络枢纽基因进行GO和KEGG分析,结果显示在跨膜受体蛋白酶活性以及miRNA与癌症的信号通路方面富集,生存分析结果显示有2个枢纽基因与CRC患者的总生存显著相关,从而明确与生存相关的ceRNA子网络并强调其作为生物标志物的潜能.结论 构建由circRNA介导的竞争性内源性RNA调控网络框架,并确定与CRC预后有显著关联的枢纽基因,可为临床应用提供了潜在的预后生物标志物.
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关键词
结直肠癌环状RNA竞争性内源RNA核心基因网络生物标志物Colorectal cancerCircular RNACompetitive endogenous RNACore gene networkBiomarkers
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1002-1256.2025.11.003
发布时间
2025-07-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
毕节市科技局科学技术联合基金项目（SY(2019)3）
贵州省卫生健康委科学技术基金项目（gzwjkj2019-1-103）
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