换一批
换一批球形棕囊藻(Phaeocystis globosa)叶绿体psaA基因片段的序列分析
Sequence Analyses of Chloroplastic psaA Gene Fragment from Phaeocystis globosa
摘要根据GenBank中检索到的南极棕囊藻(phaeocystis antarctica)psaA基因序列设计psaAL和psaAR引物,对球形棕囊藻(Phaeocystis globosa)的psaA基因片段进行PCR扩增并测序,获得了629bp的DNA序列.应用Clustal X对球形棕囊藻P1、P2株系和南极棕囊藻的psaA基因片段序列进行比对,结果表明,球形棕囊藻psaA基因片段序列无插入/缺失,核苷酸差异率为3.34%.应用DNAstar分析软件推断球形棕囊藻和南极棕囊藻的psaA基因对应的氨基酸序列和RNA二级结构,发现它们的氨基酸序列差异不大,序列中209个氨基酸只有1个发生了变化,其氨基酸变异率为048%;除部分结构域比较相似外,RNA二级结构上体现一定程度的差异,这可能对棕囊藻的分子分类研究有参考价值.因所获得的psaA基因片段序列及氨基酸序列具有种的极端保守性,不适宜用作Phaeocystis属种间的分子分类研究.
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主题词
基因(Genes)氨基酸序列(Amino Acid Sequence)叶绿体(Chloroplasts)序列分析(Sequence Analysis)分子分类(Molecular Typing)
分类号
Q949.261
栏目名称
研究论文
DOI
10.3969/j.issn.1005-3395.2004.05.008
发布时间
2004-10-09
基金项目
国家自然科学基金
广东省自然科学基金
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