换一批木榄幼苗叶片cDNA文库的构建及其表达序列标签分析
Construction of cDNA Library from Leaves of Bruguiera gymnorrhiza Seedlings and Its Expressed Sequence Tags Analysis
摘要应用SMART技术构建了25‰盐度下生长4个月的木榄叶片的cDNA文库,文库滴度为10~6 cfu mL~(-1),重组率为94.4%,插入片断长度为1～2 kb.从cDNA文库中随机挑选了96个重组克隆进行序列分析,共获得94个表达序列标签(ESTs),经质量控制和聚类拼接后得到81个unigenes,包括5个片断聚合群和76个单一序列.Blastx分析结果表明这些unigencs与GenBank的Nr数据库中已报道的基因具有较高的同源性(E<10~(-5)),它们参与呼吸代谢、光合作用、糖代谢、氨基酸代谢、脂肪酸代谢以及不饱和脂肪酸生物合成等重要的生理过程,并与机体的损伤修复、胞吞作用以及PPAR信号途径等相关.
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关键词
木榄叶cDNA文库EST序列功能分析Bruguiera gymnorrhiza,LeafcDNA libraryExpressed sequence tagsFunctional analysis
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1005-3395.2010.02.006
发布时间
2010-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
科技部863计划项目（(2007AA91402)）
教育部"新世纪优秀人才支持计划"项目（(NCET-05-0496)）
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