换一批麻竹EST-SSR标记开发及其对慈竹变异类型的分析研究
EST-SSR Molecular Marker Development from Dendrocalamus latiflorus and Its Application on Genetic Diversity Analysis of Variation Types from Bambusa emeiensis
摘要利用麻竹(Dendrocalamus latiflorus)已有的EST序列,开发了一批EST-SSR分子标记,并用于慈竹(Bambusa emeiensis)栽培变异类型的多态性研究.结果表明,在麻竹9574个EST中找到了331个EST,含有381个SSR位点,SSR 出现的频率为3.98％.EST-SSR的重复类型共有59个,其中2个核苷酸的重复最多,占63.8％,其次是3个核苷酸的重复序列.根据含有SSR的EST序列设计出了44对引物,对慈竹及其变异类型进行了扩增效率、多态性及通用性检测,其中37对引物能够扩增出稳定且清晰的条带,且扩增具有多态性,扩增片段长度主要集中在100～1000 bp,引物有效率达84.1％.遗传相似性分析结果显示,所检测样品间遗传距离为0.263～0.840,平均为0.552,其中‘黑笋慈竹’与‘琴丝慈竹’、‘蛇头慈竹’与‘龙头慈竹’之间的遗传距离较近,而‘罗汉慈竹’与其他样品的遗传距离最远.
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分类号
S795
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1005-3395.2012.05.006
发布时间
2012-11-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
林业公益性行业科研专项（(201004005)）
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