惠州市重症手足口病病原谱及EV71型VP1区基因特征分析

Pathogen spectrum analysis of severe HFMD and genetic characterization of VP1 region of enterovirus 71 in Huizhou

导出 LinkOut 学术成果认领

摘要目的分析惠州市手足口病重症病例的病原谱构成,了解惠州市肠道病毒71型分离株的VP1区基因特征,为科学防治手足口病提供科学依据.方法采集300例重症手足口病(HFMD)患者标本,采用实时荧光RT-PCR检测肠道病毒核酸,并对肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CoxA16)进行分型检测;选择8株EV71分离株进行VP1区基因全长序列测定,测序结果利用DNASTAR软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega5.0软件构建亲缘性进化树.结果通过实时荧光RT-PCR特异性检测,EV71阳性结果154份,阳性率为51.33％;CoxA16阳性结果38份,阳性率为12.67％.测序结果表明,8株EV71之间的VP1基因核苷酸同源性为96.9％～99.2％,氨基酸同源性为99.3％～100％.VP1区基因遗传进化分析表明,8株EV71分离株与C4基因亚型的代表株处于同一分支,均属于C4基因亚型的C4a进化分支.结论惠州市手足口病疫情主要病原EV71病毒均属于C4a基因亚型,与2004年以来的中国大陆EV71病毒流行的基因型一致,未产生明显的抗原漂移及变异.