换一批
换一批摘要目的 了解我国及周边亚洲地区登革1型病毒株(DENV-1)的基因型及蛋白多样性特征,为今后登革1型病毒的流行监测和防控提供理论基础.方法 从NCBI Virus Variation登革病毒数据库筛选出亚洲登革病毒1型全基因组序列共85条,利用生物信息学软件MEGA 7构建系统发生树,应用重组检测软件RDP 4.0检测可能存在的重组事件,计算同源计分比值(BSR)进行蛋白多样性分析.结果 进化树显示亚洲地区登革1型病毒分为6种基因型(Ⅰ-Ⅵ),其中Ⅰ型为优势流行基因型,Ⅵ型为新出现的基因型.同时,共发现26个重组事件,主要以基因型间的重组为主.各蛋白BSR均为0.95以上,NS2B蛋白同源计分比值最高(0.99).结论 亚洲地区登革1型病毒存在多种基因型共同流行,进化较为保守;NS2B蛋白的高度保守性,可成为抗登革病毒药物研发的理想靶点.
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分类号
R373.33
栏目名称
硕博专栏论著
DOI
10.3969/j.issn.1672-3619.2018.04.007
发布时间
2018-05-31
基金项目
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