换一批不同核酸检测试剂盒检测环境样本禽流感病毒H5亚型的效果比较
Comparison of the effectiveness of different nucleic acid detection kits in detecting avian influenza virus H5 subtypes in environmental samples
摘要目的 比较3种厂家检测禽流感病毒H5亚型的实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(Real-time RT-PCR)试剂对环境标本的检测效果.方法 采用3个不同厂家的核酸检测试剂盒检测活禽市场环境样本中的H5亚型禽流感病毒,比较不同试剂检测结果检出率的差异,使用TA克隆技术,将扩增产物连接到克隆载体上并测序分析,获得反应产物的序列.结果 3种检测试剂中,试剂盒C检测H5的检出率比A高(18.3％vs.8.4％),差异有统计学意义(x2=5.440,P=0.039).对扩增产物片段序列进行分析发现,试剂A对标本核酸的H5扩增产物与KU042758.1序列的相似度最高,为100.00％,试剂C对标本核酸的H5扩增产物与CY091635.1序列的相似度最高,为97.92％,两者无明显的相似区域.结论 试剂C比试剂A对该批临床样本中H5的检出率更高,检出率的差异可能与不同试剂靶序列不一致以及试剂引物与样本核酸的匹配度有关.
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