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应用宏基因组二代测序技术分析肺部感染患者下呼吸道病原谱

Application of metagenomic next-generation sequencing technology to analyze the spectrum of lower respiratory tract pathogens in patients with lung infection

摘要目的 应用宏基因组二代测序(mNGS)技术探究不同严重程度的肺部感染患者下呼吸道感染病原谱,以指导临床诊断及治疗.方法 选取2020年7月-2022年6月就诊于徐州医科大学附属医院呼吸与危重症医学科的肺部感染患者,根据是否符合重症肺炎诊断标准将患者分为重症感染组与非重症感染组,应用常规微生物检测和mNGS技术检测患者的肺泡灌洗液,回顾性分析所有患者的下呼吸道病原谱特征.结果 共纳入206例患者,mNGS检测阳性率91.75%(189/206)远远高于常规微生物检测方法的26.21%(54/206),差异有统计学意义(x2=3.960,P=0.047).病原体分布中人类疱疹病毒4型检出率最高,占37.57%(71/189),重症感染患者与非重症感染患者具有不同的病原体分布趋势.在混合感染的164例患者中,主要类型为细菌+真菌+病毒,占48.78%(80/164).重症感染组中细菌+真菌+病毒混合感染的发生率明显高于非重症感染组,差异有统计学意义(x2=5.170,P<0.05),其预测重症肺部感染的曲线下面积为0.76.结论 mNGS技术可在病程早期全面鉴定肺部感染病原体,并且对于混合感染的鉴定具有很大优势,为改善培养条件和制定抗生素方案提供信息,因此可用于肺部混合感染的准确诊断和个体化治疗.

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