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阿坝藏猪蒲江种群SLA-DRB基因片段SNP检测及其与生长发育性状关联分析

Single Nucleotide Polymorphisms of the Partial Sequence of SLA-DRB Gene in Pujiang Population of Tibetan Pigs and Correlation with Growth Traits

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摘要猪Sus scrofa domesticus的白细胞抗原复合体(SLA)基因的单核苷酸多态性(SNP)与猪生长发育等性状有关.为了开发藏猪品系选育的遗传标记,本文测定了阿坝藏猪蒲江种群89头个体的SLA-DRB基因部分序列,共鉴定出14个SNP位点.根据位点间的连锁强度分为3个组合(组合1:g.11470、g.11945、g.11997、g.11387、g 11369与g.11829;组合2:g.11532与g.11838;组合3:g.11911与g.11708)和4个独立多态位点(g.11468、g.11440、g.11478和g.11944).将基因型与体质量、体长等14项生长发育性状进行关联性分析,结果表明,组合3的基因型与体高、体长、胸围等11项体尺指标间的相关性均显著(FDR ＜0.05),基因型为TT/CG的个体较小,表明SLA-DRB基因可用于藏猪小型化选育的遗传标记.管围和12项管围率(除体质量以外)与SLA-DRB基因多态性的相关性最高,受组合1、组合2和位点g.11468、g.11478基因型的极显著影响(FDR＜0.001),其中,基因型为组合1=GGGAAC/GGGAAC、组合2=GT/GT、位点g.11468=C/C和g.11478=C/C的个体拥有更大的管围和管围率.管骨骨髓是SLA基因发挥免疫功能的主要场所之一.本研究为基于管围的猪种筛选提供了理论依据和可用的SNP位点,也为藏猪抗病遗传筛选提供了基础数据和参考资料.