基于线粒体cyt b基因的黑线姬鼠种群遗传多样性分析
Mitochondrial cyt b Gene-Based Genetic Diversity Analysis of Apodemus agrarius Populations in China
摘要为深入了解我国黑线姬鼠Apodemus agrarius 5个亚种的遗传分化特征,本研究结合扩增子测序技术,获得了我国16省524只黑线姬鼠的线粒体cyt b基因序列,并对其进行遗传多样性和系统进化分析.结果共检测到226个不同的cyt b单倍型,核苷酸多样性分析显示,分布于秦岭-淮河线以南的南方种群,其多样性为0.0148,明显高于东北种群的0.009 8和华北种群的0.009 5.系统进化和遗传分化系数(Fst)分析结果显示,南方种群和台湾种群的cyt b单倍型相对较古老,且与东北种群和华北种群间的Fst为0.115~0.672,产生了明显的遗传分化,而东北种群与华北种群之间遗传分化程度不明显.黑线姬鼠很可能起源于我国南部地区,海陆隔离在台湾亚种的分化中起着重要的作用,南部种群继续向北方和东北方向扩散,形成华北亚种和东北亚种,东北种群向古北界西部扩散形成指名亚种.研究结果为将来深入了解黑线姬鼠的亚种分化、扩散和生态适应性问题提供了重要的参考.
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