换一批摘要蛋白质-DNA相互作用位点在各类生理生化反应中扮演重要角色.本论文旨在构建一种可以准确预测"相互作用位点"的方法:PdDNA,其内容主要包括支持向量机和序列匹配器.支持向量机通过提取相互作用位点中心残基的特征进行训练并分类,序列匹配器则通过蛋白质特征矩阵(PSSM)对氨基酸序列进行相关性评估,对二者结果进行归一化整合,得到最终的预测结果.利用公开数据集PDNA_62,我们的PdDNA预测准确率为86.87％.为进一步验证PdDNA可靠性,我们还自建了PDNA_224数据集,其预测准确率为83.07％,处于较高水平.因此PdDNA是一种有效的"蛋白质-DNA相互作用位点"预测方法.
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分类号
Q811.4（生物工程学仿生学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.0490-6756.2020.05.028
发布时间
2020-10-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（61001149）
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