换一批酒精使用障碍的潜在关键基因生物信息学分析
Identification of potential hub genes involved in alcohol use disorder via bioinformatics analysis
摘要背景 酒精使用障碍(AUD)是一类慢性复发性脑病,遗传因素在AUD的发病过程中起重要作用.明确AUD的关键分子标志物对于进一步阐明疾病的发病机制,探索新的治疗靶点和预防复发具有重要意义.目的 应用生物信息学方法,筛选AUD的核心基因和信号通路,为AUD的防治提供新的方向.方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载基因表达数据集GSE161986.应用R软件的limma包筛选差异表达基因(DEGs).使用DAVID数据库进行基因富集分析(GSEA).使用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作网络(PPI)并寻找网络核心基因.使用GSE44456验证筛选潜在核心基因.结果 共筛选出114个DEGs.富集分析表明,差异基因主要参与信号转导、蛋白结合、细胞膜以及MAPK信号通路等功能的调控.PPI及验证分析显示,GAD1、TIMP1和CD44可能是AUD发病的潜在关键基因.结论 GAD1和TIMP1表达异常以及MAPK信号通路可能在AUD的发病过程中起关键作用,并可能作为AUD诊断和治疗的潜在分子靶点.
更多相关知识
分类号
R749（精神病学）
栏目名称
DOI
10.11886/scjsws20230331001
发布时间
2023-07-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
上海市精神卫生中心飞翔计划项目（2022-FX-01）
- 浏览0
- 被引1
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
