换一批利用条件错误发现率方法识别抑郁症和失眠症的多效性位点
Identification of genetic loci that overlap between major depressive disorder and insomnia using the conditional false discovery rate analysis
摘要背景 抑郁症和失眠症常共病存在,两者存在一些共同的发病机制,并可能受相同的多效性基因调控.既往全基因组关联研究(GWAS)一般采用单性状研究,在解释基因多效性方面存在一定的狭窄性.目的 识别与失眠症和抑郁症相关的遗传变异位点,检验抑郁症和失眠症是否存在共同的遗传因素.方法 抑郁症GWAS数据来自精神疾病遗传学联盟(PGC),共包含246363例抑郁症患者和561190例正常对照.失眠症GWAS数据来自睡眠障碍知识门户,共包含1331010例受试者.采用条件错误发现率(cFDR)和联合的条件错误发现率(ccFDR)方法筛选与抑郁症和失眠症相关的遗传位点,采用通路富集分析检验这些位点的生物学功能.结果 抑郁症和失眠症存在显著的多效性富集现象.利用cFDR方法,以cFDR<0.01作为显著性阈值,鉴定出21个易感位点与抑郁症相关(其中17个是新识别的),38个易感位点与失眠症相关(其中28个是新识别的).以ccFDR<0.05为显著性阈值,识别出16个多效性位点与抑郁症和失眠症均相关,其中15个是本研究新识别的.通路富集分析结果显示,与抑郁症和失眠症均关联的易感位点富集于突触传递相关通路,如突触后密度(GO:0014069,P=4.91E-04,FDR=4.84E-03)、不对称突触(GO:0032279,P=5.09E-0,FDR=4.84E-03)、突触后膜神经递质受体水平的调节(GO:0099072,P=5.11E-04,FDR=1.69E-02).结论 失眠症与抑郁症之间存在多效性富集现象,其共病机制与突触传递有关.
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关键词
抑郁症失眠症基因多效性条件错误发现率全基因组关联研究Major depressive disorderInsomniaPleiotropyConditional false discovery rateGenome-wide association study
分类号
R749.4（精神病学）
栏目名称
DOI
10.11886/scjsws20231113004
发布时间
2024-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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