换一批2014-2022年北京市肠道门诊分离的肠出血性大肠埃希菌分子分型特征分析
Molecular characteristics of enterohemorrhagic Escherichia coli isolated from instestinal clinics in Beijing,2014-2022
摘要目的 了解北京市肠出血性大肠埃希菌(enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)分子特征及流行趋势.方法 收集2014-2022年北京市肠道门诊分离到的肠出血性大肠埃希菌,通过药敏试验及全基因组测序及数据分析,以了解病原的药物敏感性及分子特征.结果 共收集到14株EHEC,其中4株为多耐药菌株;多位点序列分型(multi-locus sequence type,MLST)分析ST11型占比最高(5/14);血清分型O157:H7占比最高(6/14);全基因组单核苷酸分型(whole genome single nucleotide polymorphism,wgSNP)结果显示 6 株 O157:H7 菌株分成一簇,其他菌株分成一簇;14 株北京分离到的EHEC和美国国家生物技术信息中心(NCBI)网站下载的678株中国及周边国家分离的大肠埃希菌全基因组数据wgSNP分型,没有形成明显的地域性聚集,均以散发分布为主.结论 EHEC仍是北京市肠道传染病重要的病原菌,需要进一步加强EHEC监测.
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关键词
肠出血性大肠埃希菌全基因组测序多位点序列分型全基因组单核苷酸分型Enterohemorrhagic Escherichia coliWhole genome sequencingMulti-locus sequence typeWhole genome single nucleotide polymorphism
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发布时间
2024-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家科技重大专项（2018ZX10714002-003-002）
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