杜仲SQS基因的特征信息分析

Characteristic Information Analysis of Eucommia ulmoides SQS Gene

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摘要鲨烯合酶(SQS)是催化植物细胞合成甾醇和三萜类化合物的一种关键酶.为探明杜仲SQS基因家族成员的存在及其特性,本文通过生物信息学分析方法,对杜仲SQS基因(EuSQS)进行发掘,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体定位、蛋白理化性质、空间结构、调控元件等进行分析.从杜仲基因组数据中获得3条EuSQS基因,它们分布于不同的scaffold上,有5～6个外显子;EuSQS蛋白含396～440 aa,相对分子质量为45.73～49.06 kDa,均属于不稳定蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;EuSQS1和EuSQS3在结构上较为接近,二者与EuSQS2差异较大;除含有基本元件外,EuSQSs的顺式作用元件还包括光照和激素响应、分生组织表达、逆境胁迫及类黄酮生物合成等六类;在进化关系上,杜仲EuSQSs与产胶植物橡胶草及橡胶树的亲缘关系较近.分析结果为进一步对EuSQS基因的功能鉴定和利用提供了依据.

作者雷跃 ^[1] 杨仕梅 ^[1] 张天缘 ^[1] 赵德刚 ^[2] 宋莉 ^[1] 学术成果认领

作者单位贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室/贵州省农业生物工程重点实验室,贵州贵阳,550025 ^[1] 贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室/贵州省农业生物工程重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州省农业科学院,贵州贵阳 550006 ^[2]

关键词杜仲鲨烯合酶基因萜类化合物生物信息学基因结构功能预测

分类号 Q811.4

栏目名称

研究报告

DOI 10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2019.06.001

发布时间 2020-03-26

基金项目

国家转基因生物新品种培育重大专项（2016ZX08010003）