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基于结构信息的RNA多序列比对

RNA Multi-alignment based on Structural Information

摘要本研究提出了一种考虑了结构信息的同源RNA多序列比对算法,它先利用热力学方法计算出每条序列的配对概率矩阵,得到结构信息,由此构造各条序列的结构信息矢量,结合传统序列比对方法,提出优化目标函数,采用动态规划算法和渐进比对得到最后的多序列比对.试验证实了该方法的有效性.

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DOI 10.3969/j.issn.1672-6278.2009.01.001
发布时间 2009-05-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金(60471003)
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