换一批
换一批儿童肥大腺样体滤泡树突状细胞精细分群及发育路径分析
Sophisticated clustering and developmental trajectory of pediatric hypertrophic adenoid follicular dendritic cells
摘要目的 探讨儿童肥大腺样体组织滤泡树突状细胞(follicular dendritic cells,FDCs)的基因表达特征、精细分群、发育路径及转录调控网络.方法 采用单细胞转录组测序技术结合生物信息学分析手段,明确儿童肥大腺样体组织FDCs的基因表达特征及亚群分群信息;通过KEGG、GO、irGSEA等基因功能富集分析方法,阐述不同FDCs亚群生物学功能;利用拟时序分析,探索FDCs细胞亚群间的发育关系;运用SCENIC分析方法描绘不同FDCs亚群的转录调控网络.结果 共获得6个FDCs亚群,功能富集结果显示它们具有不同的功能;拟时序分析结果显示各亚群的发育分化轨迹起始于CXCL14+APOD+FDCs与SLCO2B1+PAPPA+FDCs;转录因子调控网络的分析结果提示FDCs的SCENIC分群与Seurat分群并非完全重合,多组间存在较大比例的交叉.结於 儿童肥大腺样体组织内包含多个FDCs亚群,具有多种功能,存在连续的发育分化关系,部分亚群受到相同的转录因子网络的调控.
更多相关知识
关键词
单细胞转录组测序滤泡树突状细胞腺样体肥大生物信息学分析发育路径Single-cell transcriptomic analysisFollicular dendritic cellsAdenoid hypertrophyBioinformatic analysisdevelop-mental trajectory
分类号
R765.21
栏目名称
临床研究
DOI
10.6040/j.issn.1673-3770.0.2022.109
发布时间
2024-01-08
基金项目
国家自然科学基金
- 浏览1
- 被引1
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
