摘要目的 通过转录组测序以及生物信息学分析探讨非肝硬化乙型肝炎病毒(hepatitis B viral,HBV)相关肝细胞癌的转录特征及与患者生存的关系.方法 通过转录组测序获得非肝硬化HBV相关肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的差异表达基因;利用基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库富集分析获得差异表达基因涉及的生物功能过程及信号通路;通过基因-基因功能相互作用网络分析获得关键基因;利用癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库肝癌队列对关键基因进行生存预后分析.结果 共发现上调差异基因3672 个,下调差异基因 2715 个.GO功能富集分析主要涉及细胞分化、DNA复制、DNA修复、炎症反应免疫应答、细胞黏附等.KEGG通路富集主要包括细胞周期、氧化磷酸化、p53 信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路和核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信号通路等.其中丝裂原活化蛋白激酶 3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、Ras相关C3 肉毒毒素底物 1(ras-related C3 cotulinum toxin substrate 1,RAC1)、磷脂酶Cβ1(phospholipase C beta 1,PLCβ1)、连环蛋白β1(catenin beta 1,CTNNβ1)、非转移性细胞 1(non-metastatic cells 1,NME1)基因和非转移性细胞 6(non-metastatic cells 6,NME6)基因高表达与肝癌患者预后不良相关(P＜0.05);FYN、细胞色素P450(cytochrome P450,CYP)2C8 和CYP2C9 低表达与肝癌患者预后不良有关(P＜0.05).结论 非肝硬化HBV相关肝细胞癌发生涉及多个生物学过程和信号通路的改变,与肝癌患者的生存预后相关的关键基因为理解非肝硬化HBV相关HCC发生机制提供新线索.