换一批ADCY9基因介导吉西他滨肺腺癌耐药的系统生物学研究
Systemic biological study of ADCY9 gene mediating gemcitabine resistance in lung adenocarcinoma
摘要目的 基于系统生物学模式筛选吉西他滨肺腺癌耐药的hub基因,探讨hub基因ADCY9介导吉西他滨肺腺癌耐药的分子机制.方法 采用dChip进行吉西他滨耐药差异基因分析;通过DAVID进行基因注释、生物信号通路功能聚类分析;采用STRING构建蛋白质相互作用网络,并筛选hub基因;使用Oncomine和TCGA数据库分析候选hub基因在肺腺癌等肿瘤组织中的表达情况,并进行共表达基因分析.结果 获得吉西他滨肺腺癌耐药差异基因391个,其中上调基因80个,下调基因311个;构建了蛋白质相互作用网络,获得BDKRB2、BDKRB1、POMC、ADCY9等10个hub基因;Oncomine和TCGA数据库分析显示,ADCY9基因在肺腺癌中明显表达下调,生存分析发现ADCY9基因高水平表达可降低肺腺癌总体死亡风险(log rank P=0.014);吉西他滨肺腺癌耐药组中,AD-CY9基因出现下调表达,ADCY9基因与耐药相关基因SMAD6存在相似的表达,相关性显著(P=5.6×10-27,R=0.44).ADCY9共表达基因涉及多条肿瘤耐药途径如Rho蛋白及G蛋白信号转导、MAPKK活化、钙离子负性转运等.结论 ADCY9基因可能是一种重要的肺腺癌预后标志,也可能在吉西他滨肺腺癌耐药的发生机制中起重要作用.
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分类号
R734.2（呼吸系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.13506/j.cnki.jpr.2019.12.011
发布时间
2020-03-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
广东省省级科技计划（No.2016A020215213）
广州市教育局市属高等学校科研项目（No.1201620370）
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