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肉牛 CAST 基因5′UTR 和3′UTR 多态性分析

Polymorphism Analysis on 5′UTR and 3′UTR of CAST Gene from Beef Cattle

摘要钙蛋白酶抑制蛋白( Calpastatin,CAST)专一抑制钙蛋白酶( Calpain,CAPN)活性,参与调节牛肉的嫩化及肌内蛋白的水解,其编码基因是肉质性状的主要候选基因。本研究根据牛CAST基因5′UTR区( Gen-Bank No .AY834771)和3′UTR区( GenBank No .DQ991097)序列设计两对引物,用PCR-SSCP方法对鲁西黄牛和渤海黑牛共305个样本进行了单核苷酸多态性分析。结果显示, CAST 基因5′UTR和3′UTR区存在PCR-SSCP多态,在5′UTR区存在6437(C/T)、6477(G/A)和6614(G/T)3个SNP位点,表现为AA、AB、BB、BC和AD 5种基因型;在3′UTR区存在359(T/C)和366(A/G)2个SNP位点,表现为EE、EF、FF和EG 4种基因型。经检验表明,鲁西黄牛和渤海黑牛均处于非Hardy-Weinberg平衡状态;群体遗传多态性分析表明这两种牛的多态信息含量均为中度多态。

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