换一批基于偏最小二乘路径模型的整体基因与多数量性状交互作用的统计推断
Statistical inference for detecting gene-gene interaction on multiple quantitative traits based on partial least squares path model
摘要目的 用偏最小二乘路径模型(PLSPM)推断整体基因对多数量性状的交互作用.方法 通过数据模拟的方法评价基于PLSPM统计量的稳定性与检验效能,并对实例数据中的FTO和NEGR1两个基因进行分析,研究它们对相关多数量性状的交互作用.结果 统计模拟结果显示,基于PLSPM提出的检验统计量一类错误稳定,检验效能随着样本量的增加以及效应值的增大而升高.实例数据分析表明,基因区域FTO(Chr16:52390317..52391106)和NEGR1(Chr1:71707640..71709688)对相关多数量性状的交互作用有统计学意义(P =0.039).结论 对于两个整体基因对多数量性状的交互作用研究,提出的基于PLSPM统计量是一种有效的分析方法.
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栏目名称
DOI
10.6040/j.issn.1671-7554.2013.11.023
发布时间
2016-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（31071155）
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