换一批下咽鳞癌蛋白质谱鉴定及预后靶分子筛选
Identification of proteins in hypopharyngeal squamous cell carcinoma by mass spectrometry and screening of prognostic target molecules
摘要目的 利用非数据依赖性采集(DIA)蛋白质组学技术筛选下咽鳞癌晚期肿瘤预后相关的特异性靶分子.方法 选取2016年1月至2018年9月在上海市第一人民医院确诊的5对晚期下咽鳞癌的癌组织和癌旁组织,对蛋白组织进行裂解研磨、蛋白电泳、组织酶解、肽段标记、分级标记、高效液相色谱系统分离,采用Q-Exactive质谱仪完成质谱分析.定量分析及生物信息学分析、筛选预后相关蛋白分子.结果 建立下咽鳞癌蛋白组学数据库:蛋白质7395个,肽段63190个,筛选出的差异蛋白上调36个、下调43个,差异表达蛋白质总数79个.完成层次聚类分析基因本体论和京都基因与基因组百科全书信号通路富集分析、蛋白互做分析,筛选出关键蛋白MRPS5,为下咽鳞癌预后的特异性靶分子.结论 MRPS5可能为下咽鳞状细胞癌的预后靶分子.
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