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激素性股骨头坏死患者血浆 microRNA表达谱及生物信息分析

Bioinformatic analysis of miRNA expression profile in plasma of patients with steroid-induced osteonecrosis of the femoral head

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摘要目的：分析激素性股骨头坏死（ SONFH）患者血浆microRNA表达谱变化及生物信息内容，并探讨其意义。方法选取SONFH患者（观察组）和健康志愿者（对照组）各6例，采用Real-time PCR法检测其血浆microR-NA相对表达量，筛选差异表达的microRNA。采用TargetScan、mirBase及miRanda三个在线数据库预测交集靶基因，分别进行功能富集性分析和信号转导通路富集（Pathway）分析。结果共检测768个microRNA，两组差异表达的microRNA 16个，其中观察组上调10个，比较明显的是hsa-miR-1207-5p和hsa-miR-887（观察组／对照组＞3）；下调6个，比较明显的是hsa-miR-96-5p、hsa-miR-576-5p（观察组／对照组＜0．5）。三个在线数据库共筛选出交集靶基因887个，其中上调microRNA 483个，hsa-miR-1207-5p未检出交集靶基因，hsa-miR-887检出交集靶基因为GSK3A和CASK；下调microRNA 404个，hsa-miR-96-5p检出交集靶基因114个，hsa-miR-576-5p检出59个。功能富集性分析显示，两组差异表达microRNA调控的靶基因功能主要包括解剖结构形态、间充质细胞增殖、细胞代谢过程等， Pathway分析显示靶基因明显富集于各种信号通路。结论 SONFH患者血浆microRNA 明显上调的是hsa-miR-1207-5p和hsa-miR-887，明显下调的是hsa-miR-96-5p、hsa-miR-576-5p，microRNA异常表达可能通过各信号通路参与SONFH的发病。