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精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA筛选及核心竞争性内源RNA网络构建

Screening of differentially expressed circRNAs,miRNAs,and mRNAs in peripheral blood of schizophrenia patients and construction of a core ceRNA network

摘要目的 筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制.方法 精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组.采集两组研究对象的外周血,提取总RNA后构建cDNA文库并进行高通量测序,采用R软件筛选精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA.采用miRanda和qTar数据库共同预测与差异表达miRNA相互作用的circRNA和mRNA,与差异表达的circRNA、mRNA取交集后,采用R软件构建差异表达的ceRNA网络.基于DAVID数据库对精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA进行GO和KEGG富集分析.采用string数据库构建精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA之间的PPI网络,选用cytoscape软件中cytoHubba插件筛选影响精神分裂症发生发展的核心mRNA,选择与核心mRNA存在相互作用关系的miRNA和circRNA构建精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络.结果 相比健康对照组,精神分裂症组患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA分别为31、213、2624个.构建了由差异表达的5个circRNA、4个miRNA和57个mRNA组成的ceRNA网络.精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA主要参与化学刺激的感官知觉、多细胞生物生长的负调控等生物过程,涉及泛素-泛素连接酶活性、鸟苷酸结合、酶结合等分子功能,以及细胞质、肌动蛋白细胞骨架、轴突末端等细胞成分,ceRNA网络中mRNA显著富集于NF-κB信号通路、PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、泛素介导的蛋白水解等代谢通路.构建的精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA PPI网络共包含23个节点和22条边,筛选获得影响精神分裂症发生发展的2个核心mRNA为BRCA1、GNAS.构建的精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络包含5个节点和4条边.5个节点中包含2个核心mRNA:BRCA1、GNAS,1 个miRNA:hsa-miR-502-5p,2 个circRNA:hsa_circ_0001423、hsa_circ_0008494.4 条边分别为hsa_circ_0001423/hsa-miR-502-5p/BRCA1、hsa_circ_0001423/hsa-miR-502-5p/GNAS、hsa_circ_0008494/hsa-miR-502-5p/BRCA1和hsa_circ_0008494/hsa-miR-502-5p/GNAS.结论 与健康对照人群相比,精神分裂症患者外周血中有差异表达的circRNA 31个、miRNA 213个、mRNA 2624个,最终构建了包含5个节点和4条边的核心ceRNA网络.

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作者 王艺梦 [1] 邰旭光 [2] 李小龙 [2] 刘鹏 [3] 王越 [2] 祁冬冬 [1] 学术成果认领
作者单位 呼伦贝尔市第三人民医院(呼伦贝尔市精神卫生中心)精神疾病基础及临床实验室,内蒙古 呼伦贝尔 022150;内蒙古医科大学公共卫生学院 [1] 呼伦贝尔市第三人民医院(呼伦贝尔市精神卫生中心)男性精神科 [2] 呼伦贝尔市第三人民医院(呼伦贝尔市精神卫生中心)精神疾病基础及临床实验室,内蒙古 呼伦贝尔 022150 [3]
栏目名称
DOI 10.3969/j.issn.1002-266X.2024.33.007
发布时间 2024-12-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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