牙周病与类风湿关节炎的竞争性内源RNA调控网络构建及免疫相关性分析
Construction of competitive endogenous RNA regulatory network and immunological correlation analysis of periodontal disease and rheumatoid arthritis
摘要目的 构建牙周病(PD)与类风湿关节炎(RA)的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,并分析二者的免疫相关性.方法 从美国国立生物技术信息中心建立的基因表达综合数据库获取PD与RA的数据集,通过筛选两疾病的差异基因、加权基因共表达网络分析及免疫数据集取交集获得关键基因.用受试者工作特征曲线(ROC)、基因相关性分析、单样本基因集富集分析对关键基因进行功能富集及外部数据集验证.用关键基因及数据库预测靶基因构建ceRNA调控网络,用免疫浸润分析网站分析PD与RA的免疫相关性.结果 共筛选出4个关键基因(白细胞介素10受体A、RAS相关的C3肉毒毒素底物2、布鲁顿酪氨酸激酶、F2型跨膜蛋白信号淋巴细胞活化分子家族受体),对PD与RA诊断价值较高,且基因间具有高相关性.4个关键基因参与了PD与RA的不同通路.4个关键基因和2个关键基因的靶miRNA(hsa-miR-1271-5p、hsa-let-7e-5p),分别获得9个PD的DElncRNA、16个RA的DElncRNA,构建两种疾病的ceRNA网络.PD、RA患者与正常对照者免疫细胞比例存在差异.PD患者外周血浆细胞比例较正常对照者高.而PD患者表面表达CD8亚群的细胞毒性T淋巴细胞(CD8+T淋巴细胞)、活化的自然杀伤细胞(NK细胞)、M2型巨噬细胞、静息的树突状细胞、静息的肥大细胞比例低.与正常对照者比较,RA患者滑膜中浆细胞、γδT淋巴细胞、M1型巨噬细胞的比例高.PD患者静息状态下的树突状细胞与浆细胞呈负相关;RA患者中静息状态下肥大细胞与活化肥大细胞呈负相关,M1型巨噬细胞与单核细胞呈负相关,γδT淋巴细胞与单核细胞呈负相关,M1型巨噬细胞与γδT淋巴细胞呈正相关.结论 成功筛选出4个关键基因并分别构建了PD与RA的ceRNA调控网络,PD与RA有部分免疫应答机制相同.
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