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榆林地区马铃薯纺锤块茎类病毒的RT-PCR检测与序列分析

RT-PCR Detection and Sequence Analysis of Potato Spindle Tuber Viroid in Yulin Area

摘要以陕西省榆林地区种植2~3代的马铃薯叶片为材料,首先用Trizol法提取马铃薯叶片总RNA,以已公布的马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)基因序列设计合成一对特异引物,反转录合成cDNA,通过RT-PCR扩增目的DNA片段,琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物;然后回收纯化扩增产物并进行克隆和测序,采用DNAstar软件分析序列一致性.电泳结果表明,在榆林地区的马铃薯叶片中均扩增到与预期大小一致的目的片段,说明这些马铃薯均感染了PSTVd;序列分析表明,10个不同采样点PSTVd的目的片段大小为250~251 bp,只是单个碱基之间的转换或缺失,PSTVd在榆林地区几乎没有发生变异,与国内外其他15个地区已报道的序列一致性在82.3%~ 99.5%之间.

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分类号 S435.32
栏目名称 生物技术
DOI 10.3969/j.issn.1002-2481.2014.10.01
发布时间 2014-12-09
基金项目
陕西省教育厅科研计划项目
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